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研究进展

武汉植物园在古老孑遗植物独叶草基因组学研究中取得进展

    中国植物资源丰富,但由于各种原因许多植物处于濒危状态。随着物种消失数量和速率急剧增加,探究它们濒危机理、实施有效?;て仍诿冀?。独叶草隶属于毛茛目星叶草科,为星叶草科仅存的两个物种之一。独叶草对生境非常挑剔,分布范围异常狭窄,仅在中国狭域分布,且分布范围日渐缩小,为国家一级濒危珍稀植物。 

  武汉植物园系统与进化学科组长期聚焦川东-鄂西物种多样性研究。为了探讨独叶草的濒?;?,他们联合植物生物信息学学科组,对独叶草的基因组进行了测定以及组装,获得了大小为1,004.7-Mb的基因组草图,并进行了相关分析。研究发现与DNA修复有关的基因家族在独叶草的基因组中发生了明显扩张,而与环境响应相关的基因家族发生了明显收缩;结果显示大部分叶绿体ndh基因在独叶草的基因组中发生了丢失。 

  他们推测独特的无性繁殖系统以及壮大的DNA修复系统共同降低了独叶草的遗传多样性,进而降低了其环境适应能力;与环境响应相关的基因家族数量缩以及ndh基因的丢失可能跟独叶草长期适应单一稳定的生境有关。独叶草当前极度濒危状态是气候变化、生境萎缩以及本身环境适应能力退化共同作用的结果。这提示我们,独叶草这一类弱小草本的生存是生态系统长期稳定的结果,也显示出物种之间的相互依存,因此,为了?;ふ庑┚赫芰喜畹奈镏?,同时?;ふ錾锒嘌裕哉錾肪车谋;な潜匦璧?。 

  本研究以“Genome Sequencing of the Endangered Kingdonia uniflora (Circaeasteraceae, Ranunculales) Reveals Potential Mechanisms of Evolutionary Specialization为题发表在Cell旗下新刊iScience上。本研究得到武汉植物园科研骨干人才计划项目支持,武汉植物园孙延霞与张爱娣为论文共同第一作者,武汉植物园研究员王恒昌与青年研究员张秀军为论文共同通讯作者。 

  论文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004220303096  

 

  独叶草基因组学分析 

系统与进化学科组 孙延霞

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